AT1G11410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), Apple-like (InterPro:IPR003609), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), S-locus receptor kinase, C-terminal (InterPro:IPR021820), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), EGF-like, type 3 (InterPro:IPR000742), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Concanavalin A-like lectin/glucanase (InterPro:IPR008985); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G11340.1); Has 122302 Blast hits to 120413 proteins in 4701 species: Archae - 118; Bacteria - 13948; Metazoa - 44921; Fungi - 9999; Plants - 35002; Viruses - 441; Other Eukaryotes - 17873 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3841286..3844284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 95867.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 845 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKFFFIFFIF LFSFLIQSCY SDNTILRSQS LKDGDVIYSE GKRFAFGFFS LGNSKLRYVG IWYAQVSEQT IVWVANRDHP INDTSGLIKF STRGNLCVYA 101: SGNGTEPIWS TDVIDMIQEP ALVAKLSDLG NLVLLDPVTG KSFWESFNHP TNTLLPFMKF GFTRQSGVDR IMTSWRSPGD PGSGNITYRI ERRGFPQMMM 201: YKGLTLWWRT GSWTGQRWSG VPEMTNKFIF NISFVNNPDE VSITYGVLDA SVTTRMVLNE TGTLQRFRWN GRDKKWIGFW SAPEDKCDIY NHCGFNGYCD 301: STSTEKFECS CLPGYEPKTP RDWFLRDASD GCTRIKADSI CNGKEGFAKL KRVKIPNTSA VNVDMNITLK ECEQRCLKNC SCVAYASAYH ESQDGAKGCL 401: TWHGNMLDTR TYLSSGQDFY LRVDKSELAR WNGNGASGKK RLVLILISLI AVVMLLLISF HCYLRKRRQR TQSNRLRKAP SSFAPSSFDL EDSFILEELE 501: DKSRSRELPL FELSTIATAT NNFAFQNKLG AGGFGPVYKG VLQNGMEIAV KRLSKSSGQG MEEFKNEVKL ISKLQHRNLV RILGCCVEFE EKMLVYEYLP 601: NKSLDYFIFH EEQRAELDWP KRMGIIRGIG RGILYLHQDS RLRIIHRDLK ASNVLLDNEM IPKIADFGLA RIFGGNQIEG STNRVVGTYG YMSPEYAMDG 701: QFSIKSDVYS FGVLILEIIT GKRNSAFYEE SLNLVKHIWD RWENGEAIEI IDKLMGEETY DEGEVMKCLH IGLLCVQENS SDRPDMSSVV FMLGHNAIDL 801: PSPKHPAFTA GRRRNTKTGG SSDNWPSGET SSTINDVTLT DVQGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)