AT4G32551.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : LisH dimerisation motif;WD40/YVTN repeat-like-containing domain | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
LEUNIG regulates floral organ identity,gynoecium and ovule development. Negatively regulates AGAMOUS . Encodes a glutamine-rich protein with seven WD repeats similar to transcriptional corepressors. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
LEUNIG (LUG); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: WD40 repeat 2 (InterPro:IPR019782), LisH dimerisation motif, subgroup (InterPro:IPR013720), WD40 repeat, conserved site (InterPro:IPR019775), WD40 repeat (InterPro:IPR001680), WD40 repeat-like-containing domain (InterPro:IPR011046), WD40-repeat-containing domain (InterPro:IPR017986), WD40/YVTN repeat-like-containing domain (InterPro:IPR015943), LisH dimerisation motif (InterPro:IPR006594), WD40 repeat, subgroup (InterPro:IPR019781); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: LEUNIG_homolog (TAIR:AT2G32700.6); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15707863..15713359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 102239.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 931 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSQTNWEADK MLDVYIHDYL VKRDLKATAQ AFQAEGKVSS DPVAIDAPGG FLFEWWSVFW DIFIARTNEK HSEVAASYIE TQMIKAREQQ LQQSQHPQVS 101: QQQQQQQQQQ IQMQQLLLQR AQQQQQQQQQ QHHHHQQQQQ QQQQQQQQQQ QQQQQHQNQP PSQQQQQQST PQHQQQPTPQ QQPQRRDGSH LANGSANGLV 201: GNNSEPVMRQ NPGSGSSLAS KAYEERVKMP TQRESLDEAA MKRFGDNVGQ LLDPSHASIL KSAAASGQPA GQVLHSTSGG MSPQVQTRNQ QLPGSAVDIK 301: SEINPVLTPR TAVPEGSLIG IPGSNQGSNN LTLKGWPLTG FDQLRSGLLQ QQKPFMQSQS FHQLNMLTPQ HQQQLMLAQQ NLNSQSVSEE NRRLKMLLNN 401: RSMTLGKDGL GSSVGDVLPN VGSSLQPGGS LLPRGDTDML LKLKMALLQQ QQQNQQQGGG NPPQPQPQPQ PLNQLALTNP QPQSSNHSIH QQEKLGGGGS 501: ITMDGSISNS FRGNEQVLKN QSGRKRKQPV SSSGPANSSG TANTAGPSPS SAPSTPSTHT PGDVISMPNL PHSGGSSKSM MMFGTEGTGT LTSPSNQLAD 601: MDRFVEDGSL DDNVESFLSQ EDGDQRDAVT RCMDVSKGFT FTEVNSVRAS TTKVTCCHFS SDGKMLASAG HDKKAVLWYT DTMKPKTTLE EHTAMITDIR 701: FSPSQLRLAT SSFDKTVRVW DADNKGYSLR TFMGHSSMVT SLDFHPIKDD LICSCDNDNE IRYWSINNGS CTRVYKGGST QIRFQPRVGK YLAASSANLV 801: NVLDVETQAI RHSLQGHANP INSVCWDPSG DFLASVSEDM VKVWTLGTGS EGECVHELSC NGNKFQSCVF HPAYPSLLVI GCYQSLELWN MSENKTMTLP 901: AHEGLITSLA VSTATGLVAS ASHDKLVKLW K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)