AT4G29910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : origin recognition complex protein 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Origin Recognition Complex subunit 5. Involved in the initiation of DNA replication. Interacts strongly with all ORC subunits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
origin recognition complex protein 5 (ORC5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Origin recognition complex, subunit 5 (InterPro:IPR020796); Has 287 Blast hits to 283 proteins in 127 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 140; Fungi - 92; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 12 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14628154..14630055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60641.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 534 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPPKEESSKV TRRSTRSSAS VTVENSEPIE SHTPTIDDLT FGEESITIDA VLSNFPGRRS QIFDFIRLMG PLDCPTLPIM IYGGASTGKT SVVLQVLRHL 101: NRPFVYSSCR TCYNPRILFE SILNQSLLHR KCSLNGYSSA KRCDKPSDFV NLLREALSSV IKTLESTSET SRSDKPDEKP MGKMVYLILD NVDLIRDWDK 201: GTIILQFLFS LYTVLKMPQL GIILISGLPP DVYYSNMGYT DPIPLYFPEY SEEDLRQIFL RNQPNRKLYS AFLDVVLKPF CRVTRRVEEL STTFSLLFRK 301: FCEPLDDLGI SPNEDMKRRL YSHLKPLIAH CLNEIFRVSS HPHDGETRGE RRQKASYSSE NREELEILDF HMSTSAKFLL LSAFLASRNP ATLDASMFDS 401: TGGMDNRKRK RKASEKSMEK KEIAEQEAVM KGPGSFPLER LLAIFQCIAS VGDSSFGEED EEEENTTGYD KENNNLMSDI LLQVSSLCDA NFLIKSGSCP 501: LEGSIRYRSM VSEDLAQKVA KSLSFPLSKY LYRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)