AT2G01120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : origin recognition complex subunit 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Origin Recognition Complex subunit 4. Involved in the initiation of DNA replication. Regulated transcriptionally during cell cycle, peaking at G1/S-phase. Target of E2F/DF family of transcription factors. Interacts with all ORC subunits except ORC1b. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
origin recognition complex subunit 4 (ORC4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA-type, core (InterPro:IPR003959), Origin recognition complex, subunit 4 (InterPro:IPR016527); Has 675 Blast hits to 668 proteins in 199 species: Archae - 9; Bacteria - 0; Metazoa - 335; Fungi - 166; Plants - 90; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 75 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:85444..88027 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46765.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 418 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKETPAEKS LNLIRGRLCD PSYVFRPLSA SSDSNYSKLK FIVSTSITEG CNNSMLLLGP RGSGKAAVLD LXXGXLLEQF PDSVSVIRLN GLLHSDDNCA 101: FKEIAKQLCM EHHLLFSKMA SFDDNSQFII AMLRACGLAH KTIIFVLDEF DMFAQGKQRL LYSXLDDAMQ SVTSQAVVVG ISSRLDADQL LEKRVRSRFS 201: HRKFLFLPPS REELDGLFVH LLSLPADSGF PSGYVSRFND KIKNLTSDTR FKDILKTLFN ANSTVNSFLK FIFCAVSLMN LESGLLSLEN FKAALSSMQR 301: QPKLEAVRDC SVLELYLLVC MRRLEVKEQS SYNFISVMKE YKAIHDSFHT SDYYAQNVCL RAFEHLRERQ VICYAENRGQ SQTGEYRLQK LLISASELHQ 401: GMRSHACCPA ILLKLLDH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)