AT1G74890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : response regulator 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a nuclear response regulator that acts as a negative regulator in cytokinin-mediated signal transduction. Transcript accumulates in leaves and roots in response to cytokinin treatment. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
response regulator 15 (ARR15); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: CheY-like (InterPro:IPR011006), Signal transduction response regulator, receiver domain (InterPro:IPR001789); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: response regulator 7 (TAIR:AT1G19050.1); Has 46084 Blast hits to 45371 proteins in 2654 species: Archae - 273; Bacteria - 40324; Metazoa - 30; Fungi - 580; Plants - 1499; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 3374 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28131590..28132710 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22401.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 206 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALRDLSSSL SSSSSPELHV LAVDDSFVDR KVIERLLKIS ACKVTTVESG TRALQYLGLD GDNGSSGLKD LKVNLIVTDY SMPGLTGYEL LKKIKESSAL 101: REIPVVIMSS ENIQPRIEQC MIEGAEEFLL KPVKLADVKR LKELIMRGGE AEEGKTKKLS PKRILQNDID SSPSSSSTSS SSSSHDVSSL DDDTPSSKRI 201: KLESRG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)