AT1G30360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Early-responsive to dehydration stress protein (ERD4) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
early-responsive to dehydration 4 (ERD4); INVOLVED IN: response to water deprivation; LOCATED IN: plasma membrane, chloroplast, vacuole, membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF221 (InterPro:IPR003864); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ERD (early-responsive to dehydration stress) family protein (TAIR:AT4G02900.1); Has 1361 Blast hits to 1266 proteins in 197 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 183; Fungi - 651; Plants - 396; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 131 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:10715892..10718799 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 81939.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 724 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEFGSFLVSL GTSFVIFVIL MLLFTWLSRK SGNAPIYYPN RILKGLEPWE GTSLTRNPFA WMREALTSSE QDVVNLSGVD TAVHFVFLST VLGIFACSSL 101: LLLPTLLPLA ATDNNIKNTK NATDTTSKGT FSQLDNLSMA NITKKSSRLW AFLGAVYWIS LVTYFFLWKA YKHVSSLRAQ ALMSADVKPE QFAILVRDMP 201: APPDGQTQKE FIDSYFREIY PETFYRSLVA TENSKVNKIW EKLEGYKKKL ARAEAILAAT NNRPTNKTGF CGLVGKQVDS IEYYTELINE SVAKLETEQK 301: AVLAEKQQTA AVVFFTTRVA AASAAQSLHC QMVDKWTVTE APEPRQLLWQ NLNIKLFSRI IRQYFIYFFV AVTILFYMIP IAFVSAITTL KNLQRIIPFI 401: KPVVEITAIR TVLESFLPQI ALIVFLAMLP KLLLFLSKAE GIPSQSHAIR AASGKYFYFS VFNVFIGVTL AGTLFNTVKD IAKNPKLDMI INLLATSLPK 501: SATFFLTYVA LKFFIGYGLE LSRIIPLIIF HLKKKYLCKT EAEVKEAWYP GDLSYATRVP GDMLILTITF CYSVIAPLIL IFGITYFGLG WLVLRNQALK 601: VYVPSYESYG RMWPHIHQRI LAALFLFQVV MFGYLGAKTF FYTALVIPLI ITSLIFGYVC RQKFYGGFEH TALEVACREL KQSPDLEEIF RAYIPHSLSS 701: HKPEEHEFKG AMSRYQDFNA IAGV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)