AT5G45380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : solute:sodium symporters;urea transmembrane transporters | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
DEGRADATION OF UREA 3 (DUR3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sodium/solute symporter, subgroup (InterPro:IPR019900), Sodium/solute symporter (InterPro:IPR001734); Has 9388 Blast hits to 9377 proteins in 1702 species: Archae - 173; Bacteria - 6389; Metazoa - 719; Fungi - 340; Plants - 51; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1716 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:18391337..18395696 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 75917.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 704 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATCPPFDFS TKYYDGDGGC QRQSSFFGGT TVLDQGVGYA VILGFGAFFA VFTSFLVWLE KRYVGARHTS EWFNTAGRNV KTGLIASVIV SQWTWAATIL 101: QSSNVAWQYG VSGPFWYASG ATIQVLLFGV MAIEIKRKAP NAHTVCEIVK ARWGTATHIV FLVFCLATNV VVTAMLLLGG SAVVNALTGV NLYAASFLIP 201: LGVVVYTLAG GLKATFLASY VHSVIVHVAL VVFVFLVYTS SKELGSPSVV YDRLKDMVAK SRSCTEPLSH HGQACGPVDG NFRGSYLTML SSGGAVFGLI 301: NIVGNFGTVF VDNGYWVSAI AARPSSTHKG YLLGGLVWFA VPFSLATSLG LGALALDLPI SKDEADRGLV PPATAIALMG KSGSLLLLTM LFMAVTSAGS 401: SELIAVSSLF TYDIYRTYIN PRATGRQILK ISRCAVLGFG CFMGILAVVL NKAGVSLGWM YLAMGVLIGS AVIPIAFMLL WSKANAFGAI LGATSGCVFG 501: IITWLTTAKT QYGRVDLDST GKNGPMLAGN LVAILTGGLI HAVCSLVRPQ NYDWSTTREI KVVEAYASGD EDVDVPAEEL REEKLRRAKA WIVKWGLVFT 601: ILIVVIWPVL SLPARVFSRG YFWFWAIVAI AWGTIGSIVI IGLPLVESWD TIKSVCMGMF TNDRVMKKLD DLNHRLRALT MAVPEAEKIY LLELEKTKKN 701: DEEG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)