AT2G47130.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.912 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, binding, catalytic activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Glucose/ribitol dehydrogenase (InterPro:IPR002347), Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (InterPro:IPR002198); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein (TAIR:AT3G29260.1); Has 122340 Blast hits to 122121 proteins in 3572 species: Archae - 980; Bacteria - 79164; Metazoa - 5393; Fungi - 6725; Plants - 2704; Viruses - 5; Other Eukaryotes - 27369 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:19349627..19350481 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26902.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 257 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSGLRLDGKI AIITGGASGI GAEAVRLFTD HGAKVVIVDF QEELGQNVAV SVGKDKASFY RCDVTNEKEV ENAVKFTVEK YGKLDVLFSN AGVMEQPGSF 101: LDLNLEQFDR TMAVNVRGAA AFIKHAARAM VEKGTRGSIV CTTSVASEIG GPGPHAYTAS KHALLGLVKS ACGGLGKYGI RVNGVAPYAV ATAINSRDEE 201: TVRMVEEYSA ATGILKGVVL KARHVAEAAL FLASDDSAYV SGQNLAVDGG YSVVKPI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)