AT2G03590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ureide permease 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of a class of allantoin transporters. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ureide permease 1 (UPS1); FUNCTIONS IN: allantoin uptake transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: allantoin transport; LOCATED IN: endomembrane system; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ureide permease 2 (TAIR:AT2G03530.2); Has 283 Blast hits to 283 proteins in 80 species: Archae - 0; Bacteria - 139; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 116; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 28 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:1095129..1096711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42736.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 390 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYMIESKGGA IACMLLALLF LGTWPAIMTL TERRGRLPQH TYLDYTLTNL LAAVIIALTL GEIGPSRPNF FTQLSQDNWQ SVMFAMAGGI VLSLGNLATQ 101: YAWAYVGLSV TEVITASITV VIGTTLNYFL DDRINRAEVL FPGVACFLIA VCFGSAVHKS NAADNKTKLQ NFKSLETTSS FEMETISASN GLTKGKAKEG 201: TAAFLIELEK QRAIKVFGKS TIIGLVITFF AGICFSLFSP AFNLATNDQW HTLKHGVPKL NVYTAFFYFS ISAFVVALIL NIRFLYWPIL GLPRSSFKAY 301: LNDWNGRGWS FLAGFLCGFG NGLQFMGGQA AGYAAADAVQ ALPLVSTFWG ILLFGEYRRS SRKTYTLLIS MLLMFIVAVA VLMASSGHRK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)