AT5G67520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.984 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : adenosine-5'-phosphosulfate (APS) kinase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Provides activated sulfate for the sulfation of secondary metabolites, including the glucosinolates. Redundant with APK3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
adenosine-5'-phosphosulfate (APS) kinase 4 (APK4); FUNCTIONS IN: kinase activity, transferase activity, transferring phosphorus-containing groups, ATP binding; INVOLVED IN: male gamete generation, sulfate assimilation; LOCATED IN: chloroplast, plastid; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adenylylsulphate kinase, C-terminal (InterPro:IPR002891); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: APS kinase (TAIR:AT2G14750.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:26939342..26940842 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34066.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 310 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDVAAMARCV GRCYVSPAFG ESESHRLSER RFLKLSSSTN SDPAGSKSLK LRGKIHRRMS YFRPIMAKDE SISSRSGETK QINGKQKNIV WHDCPVTKSD 101: RQELIKQKGC VIWITGLSGS GKSSLACALS RALHNRGKLS YILDGDNVRH GLNSDLSFEA DDRAENIRRV GEVAKLFADS GIICIASLIS PYRIERAACR 201: ALLPQGDFIE VFMDVPLHVC EARDPKGLYK RARAGKIKGF TGVDDPYEAP LDCEIVIQNS RDKGLSSSSS SSSSPSSSSS SLCEMADIVV SYLDQNGYLK 301: KHSTKSRNCM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)