AT5G18580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.941 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : tonneau 2 (TON2) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
fass mutants have aberrant cell shapes due to defects in arrangement of cortical microtubules. Encodes a protein highly conserved in higher plants and similar in its C-terminal part to B' regulatory subunits of type 2A protein phosphatases. Interacts with an Arabidopsis type A subunit of PP2A in the yeast two-hybrid system. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
FASS 1 (FASS); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Calcium-binding EF-hand family protein (TAIR:AT5G28850.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:6175154..6178214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55072.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 480 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYSGSSDGES HDTSTQRKIP PASSMLWVRN LRRYIGSGAG LGSEALMELE TKRILLEIFK EKQQKSQEAG TIPSFYKKKP EEGSISQRVQ KLAKYRFLKK 101: QSDLLLNADD LAAMWVCLRE NCVIDDATGA EKMNYEDFCH IASVCTEQIG PKCRRFFSPS NFMKFEKDEA GRIAILPFYL YVMRTVSLTQ ARIDMSELDE 201: DSDGFLHSDE MESYIGGLIP NLAQLRDMPP AFNQMYCRIA SQKFFFFCDP HRRGRACIKK ILLSNCLQEL MELHQESEEE VTDTEQAENW FSLTSAQRIC 301: DMFLALDKDM SGSLCKQELK EYADGTLTEI FIERVFDEHV RRGKIVAGNS REMDFDSFLD FVLALENKDT PEGLTYLFRC LDLQGRGFLT TADIHSLFRD 401: VHQKWIEGGN YELCIEDVRD EIWDMVKPSD PLKITLGDLL GCKQGGTVAS MLIDVRGFWA HDNRENLLQE EEEPPEEESQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)