AT4G26610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : D6 protein kinase like 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
D6 protein kinase like 1 (D6PKL1); FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: D6 protein kinase (TAIR:AT5G55910.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13425568..13427188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55949.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 506 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASKYGSGVL PENKKEKGDK ETPETSYSSQ SVSVNTLADQ VSSTLSFAPS SDSKTGGEVK FNEKSDQSGK SNTCRPSTSS DISDESTCSS FSGNNKPHKA 101: NDVRWEAIQA VRTKHGVLGL NHFRLLKRLG CGDIGTVHLA ELHGTRCFFA MKVMDKGALA SRKKLLRAQT EREILQCLDH PFLPTLYSHF ETEKFSCLVM 201: EFCPGGDLHT LRQRQPGKRF SEQAAKFYVA EVLLAMEYLH MLGIIYRDLK PENVLVRDDG HVMLSDFDLS LRCTVSPTVV RSTVLASEGQ KNSGYCAQPA 301: CIQQPSCISA PTTCFSPRYF SSKSKKDKKM KNETGNQVSP LPELVAEPTS ARSMSFVGTH EYLAPEIIKG EGHGSAVDWW TFGIFLYELL FGKTPFKGSG 401: NRATLFNVVG QPLRFPESPV VSFAARDLIR SLLVKEPQHR LAYKRGATEM KQHPFFEGVN WALVRCASPP EIPKPVDYES APATPAAATS TSVKSDQSNY 501: LEFDFF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)