AT4G10500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.975 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom each of oxygen into both donors, oxidoreductase activity; INVOLVED IN: secondary metabolic process; EXPRESSED IN: 12 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Oxoglutarate/iron-dependent oxygenase (InterPro:IPR005123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein (TAIR:AT4G10490.1); Has 8560 Blast hits to 8509 proteins in 1005 species: Archae - 0; Bacteria - 1116; Metazoa - 115; Fungi - 958; Plants - 4983; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1388 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6491089..6492342 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39236.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.73 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 349 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSAISKLL VSDFASSVHI PSNYVRPISD RPNLSEVESS GDSIPLIDLR DLHGPNRAVI VQQLASACST YGFFQIKNHG VPDTTVNKMQ TVAREFFHQP 101: ESERVKHYSA DPTKTTRLST SFNVGADKVL NWRDFLRLHC FPIEDFIEEW PSSPISFREV TAEYATSVRA LVLRLLEAIS ESLGLESDHI SNILGKHAQH 201: MAFNYYPPCP EPELTYGLPG HKDPTVITVL LQDQVSGLQV FKDDKWVAVS PIPNTFIVNI GDQMQVISND KYKSVLHRAV VNTENERLSI PTFYFPSTDA 301: VIGPAHELVN EQDSLAIYRT YPFVEYWDKF WNRSLATASC LDAFKAPTT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)