AT3G63150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MIRO-related GTP-ase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a calcium binding GTPases that is localized to the mitochondrion and is involved in salt stress response. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MIRO-related GTP-ase 2 (MIRO2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), EF hand associated, type-1 (InterPro:IPR013566), EF hand associated, type-2 (InterPro:IPR013567), Mitochondrial Rho-like (InterPro:IPR013684), Small GTPase, Rho type (InterPro:IPR003578), Ras GTPase (InterPro:IPR001806), Ras small GTPase, Rab type (InterPro:IPR003579), Mitochondrial Rho GTPase (InterPro:IPR021181), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), MIRO (InterPro:IPR020860); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MIRO-related GTP-ase 1 (TAIR:AT5G27540.2); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:23329200..23332692 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 71411.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 643 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMLGGKSSAG GRTSLRVAVA GDKGTGKSSL ISAVASETFP DNVPRVLPPI TLPADAFPDY IPITIVDTPS SIDNRIKLIE EFRKADVVLL TYACDQPSTL 101: DRLSSYWLPE LRRLEIKAPV IVVGCKLDLR DERSPARLED IMSPIMKEYR EIETCIECSA LTLIQVPDVF YFASKAVLHP TFPLFDQEKQ CLKPRLRRAV 201: QRIFNLCDHD LDGALNDAEL NDFQVNCFGA PLDPVELMGV KKVVQERQPD GVTDLGLTLP GFLFLFSLFI ERGRPETAWA ILRKCGYNDS LELHAELLPV 301: PAKQSPDQSI ELTNEAMDFL SGIFQLYDLD NDGALQPAEL DDLFQTAPDS PWLEDPYKEA AEKTPGGSLT INGFLSEWAL MTLLDPRKSL ANLTYIGYGH 401: DPASTFSVTR KRSVDRKKQR TERNVFQCFV FGPKKSGKSA LLDSFLGRKF SNSYKATMGE RYAANVIDQP GGSKKTLILR EIPEDRVKKF LTNKESLAAC 501: DVAVVVYDSS DVYSWRKARE ILMEVARRGE ERGYGTPCLL VAAKDDLDPY PMSVQESDRV CMELGIDIPV SLSMKLGEPN SLFSRIVSTA ENPHMSIPET 601: ESGRRSRNIR QLVNSSLLFV SVGTAVGFAG LAAYRAYSAR KNA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)