AT3G30775.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Methylenetetrahydrofolate reductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a proline oxidase that is predicted to localize to the inner mitochondrial membrane, its mRNA expression induced by high levels of Al and by osmotic stress. The promoter contains an L-proline-inducible element. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
EARLY RESPONSIVE TO DEHYDRATION 5 (ERD5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Proline dehydrogenase (InterPro:IPR002872), Proline oxidase (InterPro:IPR015659); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Methylenetetrahydrofolate reductase family protein (TAIR:AT5G38710.1); Has 2269 Blast hits to 2250 proteins in 878 species: Archae - 1; Bacteria - 1355; Metazoa - 205; Fungi - 217; Plants - 85; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 404 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:12448880..12451126 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54958.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 499 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATRLLRTNF IRRSYRLPAF SPVGPPTVTA STAVVPEILS FGQQAPEPPL HHPKPTEQSH DGLDLSDQAR LFSSIPTSDL LRSTAVLHAA AIGPMVDLGT 101: WVMSSKLMDA SVTRGMVLGL VKSTFYDHFC AGEDADAAAE RVRSVYEATG LKGMLVYGVE HADDAVSCDD NMQQFIRTIE AAKSLPTSHF SSVVVKITAI 201: CPISLLKRVS DLLRWEYKSP NFKLSWKLKS FPVFSESSPL YHTNSEPEPL TAEEERELEA AHGRIQEICR KCQESNVPLL IDAEDTILQP AIDYMAYSSA 301: IMFNADKDRP IVYNTIQAYL RDAGERLHLA VQNAEKENVP MGFKLVRGAY MSSEASLADS LGCKSPVHDT IQDTHSCYND CMTFLMEKAS NGSGFGVVLA 401: THNADSGRLA SRKASDLGID KQNGKIEFAQ LYGMSDALSF GLKRAGFNVS KYMPFGPVAT AIPYLLRRAY ENRGMMATGA HDRQLMRMEL KRRLIAGIA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)