AT4G26260.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myo-inositol oxygenase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a myo-inositol oxygenase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myo-inositol oxygenase 4 (MIOX4); FUNCTIONS IN: inositol oxygenase activity; INVOLVED IN: L-ascorbic acid biosynthetic process, syncytium formation; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF706 (InterPro:IPR007828); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myo-inositol oxygenase 5 (TAIR:AT5G56640.1); Has 490 Blast hits to 486 proteins in 159 species: Archae - 0; Bacteria - 27; Metazoa - 132; Fungi - 132; Plants - 97; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 102 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:13297939..13300146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36905.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 317 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTISVEKPIF EEVSAFEKSG DNIGELKLDG GFSMPKMDTN DDEAFLAPEM NAFGRQFRDY DVESERQKGV EEFYRLQHIN QTVDFVKKMR AEYGKLDKMV 101: MSIWECCELL NEVVDESDPD LDEPQIQHLL QSAEAIRKDY PNEDWLHLTA LIHDLGKVIT LPQFGGLPQW AVVGDTFPVG CAFDESNVHH KYFVENPDFH 201: NETYNTKNGI YSEGCGLNNV MMSWGHDDYM YLVAKENGST LPSAGQFIIR YHSFYPLHTA GEYTHLMNEE DKENLKWLHV FNKYDLYSKS KVHVDVEKVK 301: PYYMSLIKKY FPENLRW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)