AT1G15380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.599 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase (InterPro:IPR004360); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein (TAIR:AT1G80160.1); Has 780 Blast hits to 780 proteins in 276 species: Archae - 1; Bacteria - 484; Metazoa - 4; Fungi - 2; Plants - 222; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 67 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5290955..5292287 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19594.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 174 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKEDAGNPLH LTSLNHVSVL CRSVDESMNF YQKVLGFIPI RRPESLNFEG AWLFGHGIGI HLLCAPEPEK LPKKTAINPK DNHISFQCES MGVVEKKLEE 101: MGIDYVRALV EEGGIQVDQL FFHDPDGFMI EICNCDSLPV VPLVGEMARS CSRVKLHQMV QPQPQTQIHQ VVYP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)