AT3G11520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CYCLIN B1;3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a B-type mitotic cyclin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CYCLIN B1;3 (CYCB1;3); FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase regulator activity; INVOLVED IN: regulation of cell cycle, response to cyclopentenone, cell cycle; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin, A/B/D/E (InterPro:IPR014400), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cyclin family protein (TAIR:AT5G06150.1); Has 4455 Blast hits to 4454 proteins in 375 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2045; Fungi - 567; Plants - 1152; Viruses - 37; Other Eukaryotes - 654 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3625475..3627139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46269.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 414 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATGPVVHPQ PVRGDPIDLK NAAAKNRRAL GDIGNVDSLI GVEGGKLNRP ITRNFRAQLL ENAQVAAAAN KKAPILDGVT KKQEVVRAVQ KKARGDKREP 101: SKPIEVIVIS PDTNEVAKAK ENKKKVTYSS VLDARSKAAS KTLDIDYVDK ENDLAAVEYV EDMYIFYKEV VNESKPQMYM HTQPEIDEKM RSILIDWLVE 201: VHVKFDLSPE TLYLTVNIID RFLSLKTVPR RELQLVGVSA LLIASKYEEI WPPQVNDLVY VTDNSYNSRQ ILVMEKTILG NLEWYLTVPT QYVFLVRFIK 301: ASGSDQKLEN LVHFLAELGL MHHDSLMFCP SMLAASAVYT ARCCLNKTPT WTDTLKFHTG YSESQLMDCS KLLAFIHSKA GESKLRGVLK KYSKLGRGAV 401: ALISPAKSLM SSAP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)