AT2G24220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purine permease 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Member of a family of proteins related to PUP1, a purine transporter. May be involved in the transport of purine and purine derivatives such as cytokinins, across the plasma membrane. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
purine permease 5 (PUP5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF6, transmembrane (InterPro:IPR000620), Protein of unknown function DUF250 (InterPro:IPR004853); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purine permease 1 (TAIR:AT1G28230.1); Has 506 Blast hits to 495 proteins in 68 species: Archae - 4; Bacteria - 41; Metazoa - 16; Fungi - 40; Plants - 347; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 58 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:10300603..10301688 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39176.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 361 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDETTERPTV SFSYSNWISN IKKSTREAYE AKPFSHWILL FFSGAAMLIA FPASSLLSRL YFSNGGKSKW IISWVAVAGW PITCLILLPT YIFQKIKPTP 101: LNTKLVLSYV VLGFLSAADN LMYAYAYAYL PASTSSLLAS SSLAFSALFG YLIVKNPLNA SVINSIVVIT GAMAIIALDS SSDRYSYISN SQYFAGFFWD 201: IMGSALHGLI FALSELLFVK LLGRRSFHVA LEQQVMVSLT AFAFTTIGMV VSNDFQGMSH EAKSFKGGES LYTQVLVWSA VTFQLGVLGA TAVLFLASTV 301: MAGVLNAVRV PITSVAAVIL MHDPMSGFKI LSLVLTFWGF SSYIYGSSSS NSSTQASSSS S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)