AT1G59980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.969 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ARG1-like 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
ARG1-like 2 (ARL2); FUNCTIONS IN: unfolded protein binding, heat shock protein binding; INVOLVED IN: protein folding; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: embryo, leaf whorl, carpel, seed; EXPRESSED DURING: F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Molecular chaperone, heat shock protein, Hsp40, DnaJ (InterPro:IPR015609), Heat shock protein DnaJ, N-terminal (InterPro:IPR001623), Heat shock protein DnaJ (InterPro:IPR003095), Heat shock protein DnaJ, conserved site (InterPro:IPR018253); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ARG1-like 1 (TAIR:AT1G24120.1); Has 25507 Blast hits to 25492 proteins in 3344 species: Archae - 188; Bacteria - 10073; Metazoa - 4427; Fungi - 2514; Plants - 2606; Viruses - 73; Other Eukaryotes - 5626 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:22081069..22083491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46787.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 414 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATHSSRSEN KDAGEEDELR RRNPYEVLGI PSNSTDQEIK SAYRRMALRY HPDKNPDDPV AAEMFKEVTF AYEVLSDPEN RRLYDTTGSE AVGPENEDLE 101: LDLSSLGAVN TIFAALFNKL GVQIKTTVSA NLLGEALNGT VTTLPLMVGQ VVSRKVEKQS AHFYSVTLTE EEAQDGLICK VHSSAKNKFK LLYFDQVENG 201: GLSLALQEDS RKTGKLSTAG LYFFGFPVYR FDHRVNSRAL SRDPETGFFK RLDAFQPFEI TELKAGSHVF AVYGDNFFKS VSYTLEIFSS APFGNEKESL 301: RSTEAQIVSK RTELLKFEAE YHEVFAQFTE MASKCTGEVQ EIDELLKRRN EICAAYTIFP PTKQGSSKSR SWSKKKSSLL MEPREEGEVA VREEGGVKKK 401: KWYNIQLRQD KKKN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)