AT1G49140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Complex I subunit NDUFS6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Complex I subunit NDUFS6; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 (InterPro:IPR019377), Complex I subunit NDUFS6 (InterPro:IPR020163); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Complex I subunit NDUFS6 (TAIR:AT3G18410.2); Has 165 Blast hits to 165 proteins in 75 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 6; Fungi - 92; Plants - 61; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:18177696..18178269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12531.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 107 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGRKKGLPEF EESAPDGFDP ENPYKDPVAM VEMREHIVRE KWIHIEKAKI LREKVKWCYR VEGVNHYQKC RHLVQQYLDA TRGVGWGKDH RPISLHGPKP 101: VAVEEAE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)