AT1G75630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.500 vacuole 0.500 ASURE: plasma membrane,vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar H+-pumping ATPase 16 kDa proteolipid subunit 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
vacuolar H+-pumping ATPase 16 kD proteolipid (ava-p) mRNA, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
vacuolar H+-pumping ATPase 16 kDa proteolipid subunit 4 (AVA-P4); FUNCTIONS IN: ATPase activity; INVOLVED IN: ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: male gametophyte, cultured cell, pollen tube; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, F0/V0 complex, subunit C (InterPro:IPR002379), ATPase, V0 complex, proteolipid subunit C, eukaryotic (InterPro:IPR011555), ATPase, V0 complex, proteolipid subunit C (InterPro:IPR000245); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATPase, F0/V0 complex, subunit C protein (TAIR:AT1G19910.1); Has 2720 Blast hits to 2495 proteins in 678 species: Archae - 169; Bacteria - 703; Metazoa - 633; Fungi - 466; Plants - 344; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 405 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:28400662..28402032 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16686.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.68 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 166 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSGFSGDE TAPFFGFLGA AAALVFSCMG AAYGTAKSGV GVASMGVMRP ELVMKSIVPV VMAGVLGIYG LIIAVIISTG INPKAKSYYL FDGYAHLSSG 101: LACGLAGLSA GMAIGIVGDA GVRANAQQPK LFVGMILILI FAEALALYGL IVGIILSSRA GQSRAE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)