AT1G23090.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : sulfate transporter 91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AST91 mRNA for sulfate transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
sulfate transporter 91 (AST91); FUNCTIONS IN: sulfate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: sulfate transport, transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulphate transporter (InterPro:IPR011547), Sulphate transporter/antisigma-factor antagonist STAS (InterPro:IPR002645), Sulphate anion transporter, conserved site (InterPro:IPR018045), Sulphate anion transporter (InterPro:IPR001902); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sulfate transporter 3;4 (TAIR:AT3G15990.1); Has 10235 Blast hits to 10139 proteins in 1863 species: Archae - 39; Bacteria - 6188; Metazoa - 1155; Fungi - 478; Plants - 559; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1816 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr1:-:8185238..8188954 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 69074.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 9.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 631 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVHKVVAPP HKSTVAKLKT KLKETFFPDD PLRQFRGQPN RTKLIRAAQY IFPILQWCPE YSFSLLKSDV VSGLTIASLA IPQGISYAKL ANLPPIVGLY 101: SSFVPPLVYA VLGSSRDLAV GPVSIASLIL GSMLRQQVSP VDDPVLFLQL AFSSTFFAGL FQASLGILRL GFIIDFLSKA TLIGFMGGAA IIVSLQQLKG 201: LLGITHFTKH MSVVPVLSSV FQHTNEWSWQ TIVMGVCFLL FLLSTRHLSM KKPKLFWVSA GAPLLSVIVS TLLVFVFRAE RHGISVIGKL PEGLNPPSWN 301: MLQFHGSHLA LVAKTGLVTG IVSLTEGIAV GRTFAALKNY HVDGNKEMIA IGLMNVVGSA TSCYVTTGAF SRSAVNNNAG AKTAVSNIVM SVTVMVTLLF 401: LMPLFEYTPN VVLGAIIVTA VIGLIDLPAA CHIWKIDKFD FLVMLCAFFG VIFLSVQNGL AIAVGLSLFK ILMQVTRPKM VIMGNIPGTD IYRDLHHYKE 501: AQRIPGFLVL SIESPVNFAN SNYLTERTSR WIEECEEEEA QEKHSSLQFL ILEMSAVSGV DTNGVSFFKE LKKTTAKKDI ELVFVNPLSE VVEKLQRADE 601: QKEFMRPEFL FLTVAEAVAS LSLKGPSLSN V |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)