AT4G09570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of Calcium Dependent Protein Kinase (CDPK) gene family.Positive regulator of ABA signaling. Phosphorylates ABA responsive transcription factors ABF1 and ABF4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 4 (CPK4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 2 (TAIR:AT1G35670.1); Has 132709 Blast hits to 123975 proteins in 4221 species: Archae - 161; Bacteria - 14258; Metazoa - 49454; Fungi - 17991; Plants - 27137; Viruses - 592; Other Eukaryotes - 23116 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:6049560..6052184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56419.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 501 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKPNPRRPS NSVLPYETPR LRDHYLLGKK LGQGQFGTTY LCTEKSSSAN YACKSIPKRK LVCREDYEDV WREIQIMHHL SEHPNVVRIK GTYEDSVFVH 101: IVMEVCEGGE LFDRIVSKGC FSEREAAKLI KTILGVVEAC HSLGVMHRDL KPENFLFDSP SDDAKLKATD FGLSVFYKPG QYLYDVVGSP YYVAPEVLKK 201: CYGPEIDVWS AGVILYILLS GVPPFWAETE SGIFRQILQG KIDFKSDPWP TISEGAKDLI YKMLDRSPKK RISAHEALCH PWIVDEHAAP DKPLDPAVLS 301: RLKQFSQMNK IKKMALRVIA ERLSEEEIGG LKELFKMIDT DNSGTITFEE LKAGLKRVGS ELMESEIKSL MDAADIDNSG TIDYGEFLAA TLHINKMERE 401: ENLVVAFSYF DKDGSGYITI DELQQACTEF GLCDTPLDDM IKEIDLDNDG KIDFSEFTAM MKKGDGVGRS RTMRNNLNFN IAEAFGVEDT SSTAKSDDSP 501: K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)