AT2G29380.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : highly ABA-induced PP2C gene 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
highly ABA-induced PP2C gene 3 (HAI3); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: protein amino acid dephosphorylation; LOCATED IN: protein serine/threonine phosphatase complex; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein phosphatase 2C, manganese/magnesium aspartate binding site (InterPro:IPR000222), Protein phosphatase 2C-related (InterPro:IPR001932), Protein phosphatase 2C (InterPro:IPR015655), Protein phosphatase 2C, N-terminal (InterPro:IPR014045); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: highly ABA-induced PP2C gene 2 (TAIR:AT1G07430.1); Has 6960 Blast hits to 6933 proteins in 604 species: Archae - 4; Bacteria - 618; Metazoa - 1585; Fungi - 779; Plants - 2700; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 1267 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:12608855..12610124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40299.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 362 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEICYEVVT DACPSSVYES TPAHSRRRPR FQTVMHEDWE KNCKRSKQEA LATRYSSIPR SSREDFSDQN VDVSSPRYGV SSVCGRRREM EDAVAIHPSF 101: SSPKNSEFPQ HYFGVYDGHG CSHVAARCRE RLHKLVQEEL SSDMEDEEEW KTTMERSFTR MDKEVVSWGD SVVTANCKCD LQTPACDSVG STAVVSVITP 201: DKIVVANCGD SRAVLCRNGK PVPLSTDHKP DRPDELDRIE GAGGRVIYWD CPRVLGVLAM SRAIGDNYLK PYVSCEPEVT ITDRRDDDCL ILASDGLWDV 301: VSNETACSVA RMCLRGGGRR QDNEDPAISD KACTEASVLL TKLALARNSS DNVSVVVIDL RR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)