AT5G62050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homolog of yeast oxidase assembly 1 (OXA1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
essential factor for protein sorting and assembly into membranes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homolog of yeast oxidase assembly 1 (OXA1) (OXA1); FUNCTIONS IN: P-P-bond-hydrolysis-driven protein transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: protein import into mitochondrial inner membrane, protein complex assembly; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial inner membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Membrane insertion protein, OxaA/YidC (InterPro:IPR001708), Membrane insertion protein, OxaA/YidC, core (InterPro:IPR020001); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: inner membrane protein OXA1-like (TAIR:AT2G46470.1); Has 6982 Blast hits to 6979 proteins in 2374 species: Archae - 0; Bacteria - 4991; Metazoa - 235; Fungi - 246; Plants - 190; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1320 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:24924062..24926758 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47862.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 429 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFRQTLSIR SRLFARRNQP VYHIIPRESD HERDSFCQET SQRSYHSFLH QRSVNNSDFS KVSGGSLHLP LAPTSGFAFY RYMSSAPGVG SEKIGVMSDI 101: AEVITDSTLQ DVPAQAAAAV SEVTLAAADS FFPIAALQQC IDMVHTFTGF EWWASIVVAT ILIRSSTVPL LIKQMKDTTK LALMRPRLES IREEMQNKGM 201: DSVTMAEGQK KMKNLFKEYG VTPFTPMKGM FIQGPLFICF FLAIRNMAEK VPSFQTGGAL WFTDLTTPDS LYILPVITGL TFLITVECNA QEGMEGNPMA 301: GTVKTVCRVF ALLTVPMTMS FPQAIFCYWI TSNLFSLMYG LVIKRPQVKK MLRIPDLPPP PPGQQPSFDL FSALKKMKAM TQDHTQNQIE PPSPVNPRLS 401: STSLSPVSKR LKALESQVKG RKKNSSKKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)