AT2G44520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome c oxidase 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome c oxidase 10 (COX10); FUNCTIONS IN: protoheme IX farnesyltransferase activity, prenyltransferase activity; INVOLVED IN: heme o biosynthetic process, heme biosynthetic process; LOCATED IN: integral to membrane, mitochondrial membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protohaem IX farnesyltransferase, mitochondria (InterPro:IPR016315), Protohaem IX farnesyltransferase (InterPro:IPR006369), UbiA prenyltransferase (InterPro:IPR000537); Has 7990 Blast hits to 7990 proteins in 1845 species: Archae - 160; Bacteria - 4430; Metazoa - 177; Fungi - 179; Plants - 66; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2978 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18379660..18381731 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46477.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 431 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWRRSVVYRF SSRISVSSSL PNPRLIPWSR ELCAVNSFSQ PPVSTESTAK LGITGVRSDA NRVFATATAA ATATATTGEI SSRVAALAGL GHHYARCYWE 101: LSKAKLSMLV VATSGTGYIL GTGNAAISFP GLCYTCAGTM MIAASANSLN QIFEISNDSK MKRTMLRPLP SGRISVPHAV AWATIAGASG ACLLASKTNM 201: LAAGLASANL VLYAFVYTPL KQLHPINTWV GAVVGAIPPL LGWAAASGQI SYNSMILPAA LYFWQIPHFM ALAHLCRNDY AAGGYKMLSL FDPSGKRIAA 301: VALRNCFYMI PLGFIAYDWG LTSSWFCLES TLLTLAIAAT AFSFYRDRTM HKARKMFHAS LLFLPVFMSG LLLHRVSNDN QQQLVEEAGL TNSVSGEVKT 401: QRRKKRVAQP PVAYASAAPF PFLPAPSFYS P |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)