AT5G59740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.647 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-N-acetylglucosamine (UAA) transporter family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-N-acetylglucosamine (UAA) transporter family; FUNCTIONS IN: galactose transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transmembrane transport; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UAA transporter (InterPro:IPR013657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-galactose transporter 5 (TAIR:AT3G46180.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:24070310..24072747 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38220.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 344 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEPELVNGG VKENKLWKGV FAVSGIMSTL VIYGVLQEKI MRVPYGVNKE FFKHSLFLVF CNRLTTSAVS AGALLASKKV LDPVAPVYKY CLISVTNILT 101: TTCQYEALKY VSFPVQTLAK CAKMIPVMVW GTLIMQKKYK GFDYLVAFLV TLGCSVFILF PAGDDVSPYN KGRENTVWGV SLMAGYLGFD GFTSTFQDKL 201: FKGYNMEIHN QIFYTTLCSC VLSFTGLILQ GHLLPAVDFV SLHRDCLLDI ALLSTVATAS QFFISYTIRT FGALTFAAIM TTRQLASIML SCIWFSHPLS 301: WEQCIGSVIV FGSLYAKNLL NNKKNSQTQP PPPELPQYEK VESS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)