AT5G44635.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
MINICHROMOSOME MAINTENANCE 6 (MCM6); FUNCTIONS IN: DNA-dependent ATPase activity, DNA binding, ATP binding; INVOLVED IN: cell proliferation, DNA-dependent DNA replication initiation, DNA unwinding involved in replication; LOCATED IN: nuclear chromatin; EXPRESSED IN: shoot apex; EXPRESSED DURING: IL.00 inflorescence just visible; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027), Nucleic acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340), DNA-dependent ATPase MCM (InterPro:IPR001208), DNA-dependent ATPase MCM, conserved site (InterPro:IPR018525), MCM protein 6 (InterPro:IPR008049); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein (TAIR:AT2G16440.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:18006431..18010542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 92856.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 831 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAFGGFVMD EQAIQVENVF LEFLKSFRLD ANKPELYYEA EIEAIRGGES TMMYIDFSHV MGFNDALQKA IADEYLRFEP YLRNACKRFV IEMNPSFISD 101: DTPNKDINVS FYNLPFTKRL RELTTAEIGK LVSVTGVVTR TSEVRPELLY GTFKCLDCGS VIKNVEQQFK YTQPTICVSP TCLNRARWAL LRQESKFADW 201: QRVRMQETSK EIPAGSLPRS LDVILRHEIV EQARAGDTVI FTGTVVVIPD ISALAAPGER AECRRDSSQQ KSSTAGHEGV QGLKALGVRD LSYRLAFIAN 301: SVQIADGSRN TDMRNRQNDS NEDDQQQFTA EELDEIQQMR NTPDYFNKLV GSMAPTVFGH QDIKRAVLLM LLGGVHKTTH EGINLRGDIN VCIVGDPSCA 401: KSQFLKYTAG IVPRSVYTSG KSSSAAGLTA TVAKEPETGE FCIEAGALML ADNGICCIDE FDKMDIKDQV AIHEAMEQQT ISITKAGIQA TLNARTSILA 501: AANPVGGRYD KSKPLKYNVN LPPAILSRFD LVYVMIDDPD EVTDYHIAHH IVRVHQKHEA ALSPEFTTVQ LKRYIAYAKT LKPKLSPEAR KLLVESYVAL 601: RRGDTTPGTR VAYRMTVRQL EALIRLSEAI ARSHLEILVK PSHVLLAVRL LKTSVISVES GDIDLSEYQD ANGDNMDDTD DIENPVDGEE DQQNGAAEPA 701: SATADNGAAA QKLVISEEEY DRITQALVIR LRQHEETVNK DSSELPGIRQ KELIRWFIDQ QNEKKKYSSQ EQVKLDIKKL RAIIESLVCK EGHLIVLANE 801: QEEAAEAEET KKKSSQRDER ILAVAPNYVI E |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)