AT2G16440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
MINICHROMOSOME MAINTENANCE 4 (MCM4); FUNCTIONS IN: nucleoside-triphosphatase activity, DNA-dependent ATPase activity, DNA binding, nucleotide binding, ATP binding; INVOLVED IN: cell proliferation, DNA-dependent DNA replication initiation, DNA unwinding involved in replication; LOCATED IN: nuclear chromatin; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027), Nucleic acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), DNA-dependent ATPase MCM (InterPro:IPR001208), DNA-dependent ATPase MCM, conserved site (InterPro:IPR018525), MCM protein 4 (InterPro:IPR008047); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein (TAIR:AT5G44635.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:7126536..7130665 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 93661.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 847 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASDSSLGNT NDGPPSPGEN VSSPIENTYS SPAALHRRRR GRSSTPTQFA TPPPPPSRLA SSNSTPPTSR PSAARSKGRN GHGGGGGGGG GGDPGTPMST 101: DEPLPSSDDG EEDGGDDTTP TFVWGTNISV QDVKSAIEMF VKHFREAREN SDDLFREGKY MVSIRKVIEI EGEWIDVDAF DVFDYDPDLY NKMVRYPLEV 201: LAIFDIVLMD IVSTINRLFE KHVQVRIFNL RTSTSMRNLN PSDIEKMISL KGMIIRSSSI IPEIREAVFR CLVCGYFSDP IIVDRGKISE PPTCLKQECM 301: TKNSMTLVHN RCRFADKQIV RLQETPDEIP EGGTPHTVSL LLHDKLVDNG KPGDRIEVTG IYRAMTVRVG PAHRTVKSVF KTYIDCLHIK KASKLRMSAE 401: DPMDVDNSLR RVDEDVELDE EKLRKFQELS KQPDIYERLS RSLAPNIWEL DDVKKGLLCQ LFGGNALNLA SGANFRGDIN ILLVGDPGTS KSQLLQYIHK 501: LSPRGIYTSG RGSSAVGLTA YVAKDPETGE TVLESGALVL SDRGICCIDE FDKMSDSARS MLHEVMEQQT VSIAKAGIIA SLNARTSVLA CANPSGSRYN 601: PRLSVIENIH LPPTLLSRFD LIYLILDKPD EQTDRRLAKH IVALHFENAE SAQEEAIDIT TLTTYVSYAR KNIHPKLSDE AAEELTRGYV ELRKAGKFAG 701: SSKKVITATP RQIESLIRLS EALARMRFSE WVEKHDVDEA FRLLRVAMQQ SATDHATGTI DMDLINTGVS ASERMRRDTF ASSIRDIALE KMQIGGSSMR 801: LSELLEELKK HGGNINTEIH LHDVRKAVAT LASEGFLVAE GDRIKRV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)