AT5G37310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Endomembrane protein 70 protein family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Endomembrane protein 70 protein family; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nonaspanin (TM9SF) (InterPro:IPR004240); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Endomembrane protein 70 protein family (TAIR:AT2G01970.1); Has 1577 Blast hits to 1526 proteins in 319 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 611; Fungi - 238; Plants - 464; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 262 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:14772836..14776093 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68083.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 593 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVLLPSMTSL LLVFLFLYGV SPVISDGSDH RYKVGDDVPL YANKVGPFHN PSETYRYFDL PFCSSAPVKE KKEALGEVLN GDRLVSAPYK LEFLGEKNSE 101: VACRKRLSRE DVAKFRDVIA KDYYFQMYYD DLPIWGFLGK VVKEGKTDPS EYKYYLFNHL QFEIFYNKDR VIEIIVRTDQ NFLVDLTEDK EVQVDFTYTV 201: RWKETEIPFE KRMEKYSLAS SMPHHLEIHW FSIINSCVTV LLLTGFLATI LMRVLKNDFV KYAHDEEAVD DQEETGWKLI HGDVFRFPKH KSLLAAALGS 301: GTQLFTLAVF IFMLALVGVF YPYNRGALFT ALVVIYALTS GIAGYTAASF YCQLEGTNWV RNVILTGSLF CGPLLITFSF LNTVAIAYQA TAALPFGTIV 401: VIFLIWALVT SPLLILGGIA GKNRKSEFQA PCRTTKYPRE IPPMRWYRRT LPQMAMAGFL PFSAIYIELY YIFASVWGHR IYTIYSILSI VFLILVIVTA 501: FITVALTYFQ LAAEDHEWWW RSLLCGGSTG LFIYAYCLYY YYARSDMSGF MQTSFFFGYM ACICYGFFLM LGTIGFCASL LFVRHIYRSI KCE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)