AT5G15470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 0.932 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 14 (GAUT14); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 13 (TAIR:AT3G01040.2); Has 1751 Blast hits to 1745 proteins in 385 species: Archae - 0; Bacteria - 750; Metazoa - 147; Fungi - 0; Plants - 822; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 30 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:5021433..5024168 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60826.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 532 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQLHISPSMR SITISSSNEF IDLMKIKVAA RHISYRTLFH TILILAFLLP FVFILTAVVT LEGVNKCSSI DCLGRRIGPR LLGRVDDSER LARDFYKILN 101: EVSTQEIPDG LKLPNSFSQL VSDMKNNHYD AKTFALVLRA MMEKFERDMR ESKFAELMNK HFAASSIPKG IHCLSLRLTD EYSSNAHARR QLPSPEFLPV 201: LSDNAYHHFI LSTDNILAAS VVVSSAVQSS SKPEKIVFHI ITDKKTYAGM HSWFALNSVA PAIVEVKGVH QFDWLTRENV PVLEAVESHN GVRDYYHGNH 301: VAGANLTETT PRTFASKLQS RSPKYISLLN HLRIYIPELF PNLDKVVFLD DDIVVQGDLT PLWDVDLGGK VNGAVETCRG EDEWVMSKRL RNYFNFSHPL 401: IAKHLDPEEC AWAYGMNIFD LQAWRKTNIR ETYHSWLREN LKSNLTMWKL GTLPPALIAF KGHVHIIDSS WHMLGLGYQS KTNIENVKKA AVIHYNGQSK 501: PWLEIGFEHL RPFWTKYVNY SNDFIKNCHI LE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)