AT2G20370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Exostosin family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a xyloglucan galactosyltransferase located in the membrane of Golgi stacks that is involved in the biosynthesis of fucose. It is also involved in endomembrane organization. It is suggested that it is a dual-function protein that is responsible for actin organization and the synthesis of cell wall materials. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MURUS 3 (MUR3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Exostosin-like (InterPro:IPR004263); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Exostosin family protein (TAIR:AT2G29040.1); Has 481 Blast hits to 480 proteins in 27 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 8; Fungi - 4; Plants - 455; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:8792355..8794214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 70747.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 619 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFPRVSMRRR SAEVSPTEPM EKGNGKNQTN RICLLVALSL FFWALLLYFH FVVLGTSNID KQLQLQPSYA QSQPSSVSLR VDKFPIEPHA APSKPPPKEP 101: LVTIDKPILP PAPVANSSST FKPPRIVESG KKQEFSFIRA LKTVDNKSDP CGGKYIYVHN LPSKFNEDML RDCKKLSLWT NMCKFTTNAG LGPPLENVEG 201: VFSDEGWYAT NQFAVDVIFS NRMKQYKCLT NDSSLAAAIF VPFYAGFDIA RYLWGYNISR RDAASLELVD WLMKRPEWDI MRGKDHFLVA GRITWDFRRL 301: SEEETDWGNK LLFLPAAKNM SMLVVESSPW NANDFGIPYP TYFHPAKDSE VFEWQDRMRN LERKWLFSFA GAPRPDNPKS IRGQIIDQCR NSNVGKLLEC 401: DFGESKCHAP SSIMQMFQSS LFCLQPQGDS YTRRSAFDSM LAGCIPVFFH PGSAYTQYTW HLPKNYTTYS VFIPEDDVRK RNISIEERLL QIPAKQVKIM 501: RENVINLIPR LIYADPRSEL ETQKDAFDVS VQAVIDKVTR LRKNMIEGRT EYDYFVEENS WKYALLEEGQ REAGGHVWDP FFSKPKPGED GSSDGNGGTT 601: ISADAAKNSW KSEQRDKTQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)