AT5G02110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CYCLIN D7;1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CYCLIN D7;1 (CYCD7;1); FUNCTIONS IN: cyclin-dependent protein kinase activity; INVOLVED IN: regulation of cell cycle; LOCATED IN: nucleus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cyclin, C-terminal (InterPro:IPR004367), Cyclin D (InterPro:IPR015451), Cyclin-like (InterPro:IPR011028), Cyclin-related (InterPro:IPR013763), Cyclin, N-terminal (InterPro:IPR006671), Cyclin (InterPro:IPR006670); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CYCLIN D3;2 (TAIR:AT5G67260.1); Has 2441 Blast hits to 2441 proteins in 290 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 935; Fungi - 354; Plants - 916; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 236 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:417087..418553 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39914.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 341 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDNLLCEESW PASPLTPEPL PNFRHRSHDN DVVKMYPEID AATMEEAIAM DLEKELCFNN HGDKFVEFFV SKKLTDYRFH AFQWLIQTRS RLNLSYETVF 101: SAANCFDRFV YMTCCDEWTN WMVELVAVTS LSIASKFNEV TTPLLEELEM EGLTHMFHVN TVAQMELIIL KALEWRVNAV TSYTFSQTLV SKIGMVGDHM 201: IMNRITNHLL DVICDLKMLQ YPPSVVATAA IWILMEDKVC RESIMNLFEQ NHKEKIVKCV DGMKNRDIDH QSSRRRYSEG RSILSLLQRG DVMNMNGDYN 301: VEDLSKIFQI FRYEKKKRDR GNHQDNIRPA KRMTIEMSNY I |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)