AT4G32360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, binding, catalytic activity; INVOLVED IN: metabolic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Adrenodoxin reductase (InterPro:IPR000759), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NADH-dependent glutamate synthase 1 (TAIR:AT5G53460.3); Has 9342 Blast hits to 9327 proteins in 2028 species: Archae - 136; Bacteria - 6683; Metazoa - 218; Fungi - 274; Plants - 105; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1926 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15621550..15624711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53072.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 483 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSRYLARYMV SRYFSSASSR PLHVCIVGSG PAGFYTADKV LKAHEGAHVD IIDRLPTPFG LVRSGVAPDH PETKIAINQF SRVAQHERCS FIGNVKLGSD 101: LSLSELRDLY HVVVLAYGAE SDKDLGIPGE SLSGIYSARE FVWWYNGHPD YSSLKPDLKT SDSAVILGQG NVALDVARIL LRPTTELAST DIATHALSAL 201: KESSIRKVYL IGRRGPVQAA LTAKELREVL GIKNLHIRIK QTDLSVTPAD EEEMKTSRAR KRIYELLSKA AAAAKTSEAD PDQRELHFVF FRQPDQFLES 301: DERKGHVSGV NLQKTILESV GTGKQIAVGT GEFEDLNCSM VLKAIGYKSV PVNGLPFDHK KGVVPNVKGR VVSHTSGDIS QTEPGLYVCG WLKRGPVGII 401: ATNLYCAEET VGSISEDIEE GVWKSSKAGS KGLMQLLEKR KVKKVEFSGW EKIDAKEKQM GIERNKPREK LVTWEDLLAA AAN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)