AT4G30000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Dihydropterin pyrophosphokinase / Dihydropteroate synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Dihydropterin pyrophosphokinase / Dihydropteroate synthase; FUNCTIONS IN: 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase activity, dihydropteroate synthase activity; INVOLVED IN: pteridine and derivative metabolic process, cellular metabolic process, folic acid and derivative biosynthetic process; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dihydropteroate synthase-like (InterPro:IPR011005), 7,8-Dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase, HPPK (InterPro:IPR000550), Dihydropteroate synthase (InterPro:IPR006390), Pterin-binding (InterPro:IPR000489); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dihydropterin pyrophosphokinase / Dihydropteroate synthase (TAIR:AT1G69190.1); Has 14894 Blast hits to 14858 proteins in 2526 species: Archae - 148; Bacteria - 9690; Metazoa - 8; Fungi - 166; Plants - 69; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4813 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14670524..14672397 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60741.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 554 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPLLSQTLI HTGRFLLRRF LEPPPAVISA VAASRVCFHR YYSSKSLSLV SPLGLHCSSL FSPPALCNSA FSSSATSTTI EVQSTEHEVV IALGSNIGNR 101: MNNFREALRL MKRGGICVTR HSCLYETAPV HVTDQPRFLN AAVRGVTKLG PHELLSVLKT IERDMGRKDG IRYGPRPLDL DILFYGKMRI SSDKLIIPHE 201: RLWERSFVLA PLVDLLGSAV DNDTVAHWHS LAIHPGGIFQ AWERLGGESL IGQDGIQRVL PIGDKLWDFS NKTHVMGILN LTPDSFSDGG KFQSIDSAVS 301: RVRSMISEGA DIIDIGAQST RPMASRISSQ EELDRLLPVL EAVRGMPEME EKLISVDTFN SEVASEAISN GADILNDVSA GTLDPNMHKV VAESGVPYMA 401: MHMRGDPCTM QNKENLQYDD VCKDVASELY LRVRDAELSG IPAWRVMIDP GIGFSKSVDH NLDIIMDLPK IREEMAKRSI AVSHAPILVG PSRKRFLGDI 501: CGRPEATDRD AATVASVTAG ILGGANIIRV HNVRHNADAA KVCDAMLRRR RSKG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)