AT4G39120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myo-inositol monophosphatase like 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a chloroplast-localized member of the myo-inositol monophosphatase family, IMPL2 (myo-Inositol monophosphatase like 2) that seems to have multiple enzymatic activities. It contributes to histidine biosynthesis based on it histidinol-phosphate phosphatase activity. In addition, the protein can act as an inositol monophosphatase and an L-galactose-1-phosphate phosphatase in vitro. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myo-inositol monophosphatase like 2 (IMPL2); FUNCTIONS IN: histidinol-phosphatase activity, 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase activity, L-galactose-1-phosphate phosphatase activity, inositol or phosphatidylinositol phosphatase activity, inositol-1(or 4)-monophosphatase activity; INVOLVED IN: sulfur metabolic process, histidine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histidinol-phosphate phosphatase, putative, inositol monophosphatase (InterPro:IPR011809), Inositol monophosphatase (InterPro:IPR000760), Inositol monophosphatase, metal-binding site (InterPro:IPR020583); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Inositol monophosphatase family protein (TAIR:AT3G02870.1); Has 15134 Blast hits to 15130 proteins in 2267 species: Archae - 157; Bacteria - 8374; Metazoa - 557; Fungi - 304; Plants - 238; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5504 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:18225578..18227988 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41761.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 375 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRLHNRDLSI QTFSVVDDWL FRELPTHSKM LAQSHFFSKS FDLIPPQSPA LRSANPSLRI SSSYSNSRLS FLSSSAIAVP VSRRRFCLTM ASNSKRPNIS 101: NESPSELSDT ELDRFAAVGN ALADASGEVI RKYFRKKFDI VDKDDMSPVT IADQMAEEAM VSIIFQNLPS HAIYGEEKGW RCKEESADYV WVLDPIDGTK 201: SFITGKPVFG TLIALLYKGK PILGLIDQPI LKERWIGMNG RRTKLNGEDI STRSCPKLSQ AYLYTTSPHL FSEEAEKAYS RVRDKVKVPL YGCDCYAYAL 301: LASGFVDLVI ESGLKPYDFL ALVPVIEGAG GTITDWTGKR FLWEASSSAV ATSFNVVAAG DSDIHQQALE SLEWH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)