AT4G23190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes putative receptor-like protein kinase that is induced by the soil-borne vascular bacteria, Ralstonia solanacearum. Naming convention from Chen et al 2003 (PMID 14756307) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 11 (CRK11); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Protein of unknown function DUF26 (InterPro:IPR002902), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 22 (TAIR:AT4G23300.1); Has 122786 Blast hits to 121167 proteins in 4390 species: Archae - 103; Bacteria - 13685; Metazoa - 45057; Fungi - 10628; Plants - 34657; Viruses - 456; Other Eukaryotes - 18200 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:12141197..12143710 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 74143.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 667 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKQRSLFSVL CFFFISFGVA SVSAQTCTTD KGTFRPNGTY DVNRRLILSS LPSNVTDQDG LYYNGSIGQQ PNRVYAIGMC IPGSTSEDCS DCIKKESEFF 101: LKNCPNQTEA YSWPGEPTLC YVRYSNTSFS GSADLNPRNW LTNTGDLDSN LTEFTKIWEG LMGRMISAAS TAKSTPSSSD NHYSADSAVL TPLLNIYALM 201: QCTPDLSSGD CENCLRQSAI DYQSCCSQKR GGVVMRPSCF LRWDLYTYSN AFDNLTVASP PPEPPVTVPQ PAGDQDNPTN NDSKGISAGV VVAITVPTVI 301: AILILLVLGF VLFRRRKSYQ RTKTESESDI STTDSLVYDF KTIEAATNKF STSNKLGEGG FGAVYKGKLS NGTDVAVKRL SKKSGQGTRE FRNEAVLVTK 401: LQHRNLVRLL GFCLEREEQI LIYEFVHNKS LDYFLFDPEK QSQLDWTRRY KIIGGIARGI LYLHQDSRLK IIHRDLKASN ILLDADMNPK IADFGLATIF 501: GVEQTQGNTN RIAGTYAYMS PEYAMHGQYS MKSDIYSFGV LVLEIISGKK NSGVYQMDET STAGNLVTYA SRLWRNKSPL ELVDPTFGRN YQSNEVTRCI 601: HIALLCVQEN PEDRPMLSTI ILMLTSNTIT LPVPRLPGFF PRSRQLKLVS EGSESDQYTS KSSSFSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)