AT4G18700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.523 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : CBL-interacting protein kinase 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes CBL-interacting protein kinase 12 (CIPK12). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CBL-interacting protein kinase 12 (CIPK12); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: signal transduction, protein amino acid phosphorylation; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), NAF/FISL domain (InterPro:IPR018451), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), NAF domain (InterPro:IPR004041), CBL-interacting protein kinase (InterPro:IPR020660), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: CBL-interacting protein kinase 19 (TAIR:AT5G45810.1); Has 132740 Blast hits to 130588 proteins in 4556 species: Archae - 205; Bacteria - 15732; Metazoa - 48597; Fungi - 13262; Plants - 32355; Viruses - 523; Other Eukaryotes - 22066 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:10289110..10290579 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55020.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 489 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAEKITRETS LPKERSSPQA LILGRYEMGK LLGHGTFAKV YLARNVKTNE SVAIKVIDKE KVLKGGLIAH IKREISILRR VRHPNIVQLF EVMATKAKIY 101: FVMEYVRGGE LFNKVAKGRL KEEVARKYFQ QLISAVTFCH ARGVYHRDLK PENLLLDENG NLKVSDFGLS AVSDQIRQDG LFHTFCGTPA YVAPEVLARK 201: GYDAAKVDIW SCGVILFVLM AGYLPFHDRN VMAMYKKIYR GEFRCPRWFS TELTRLLSKL LETNPEKRFT FPEIMENSWF KKGFKHIKFY VEDDKLCNVV 301: DDDELESDSV ESDRDSAASE SEIEYLEPRR RVGGLPRPAS LNAFDIISFS QGFDLSGLFD DDGEGSRFVS GAPVSKIISK LEEIAKVVSF TVRKKDCRVS 401: LEGSRQGVKG PLTIAAEIFE LTPSLVVVEV KKKGGDKTEY EDFCNNELKP KLQNLTADDV VAEPVAVSAV DETAIPNSPT ISFLPSDTE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)