AT4G16110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : response regulator 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a pollen-specific transcription factor involved in the expression of nuclear genes for components of mitochondrial complex I in Arabidopsis. Acts in concert with other type-B ARRs in the cytokinin signaling pathway. AHK3 mediates cytokinin-induced phosphorylation of ARR2 on the Asp-80 residue. This phosphorylation plays a positive role of ARR2 in cytokinin-mediated control of leaf longevity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
response regulator 2 (RR2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Response regulator, plant B-type (InterPro:IPR017053), Myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class (InterPro:IPR006447), CheY-like (InterPro:IPR011006), Homeodomain-like (InterPro:IPR009057), Myb, DNA-binding (InterPro:IPR014778), Signal transduction response regulator, receiver domain (InterPro:IPR001789), HTH transcriptional regulator, Myb-type, DNA-binding (InterPro:IPR017930), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: response regulator 1 (TAIR:AT3G16857.2); Has 95443 Blast hits to 94483 proteins in 2985 species: Archae - 623; Bacteria - 84652; Metazoa - 47; Fungi - 382; Plants - 2721; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 7016 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:9112979..9115785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72582.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 664 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVNPGHGRGP DSGTAAGGSN SDPFPANLRV LVVDDDPTCL MILERMLMTC LYRVTKCNRA ESALSLLRKN KNGFDIVISD VHMPDMDGFK LLEHVGLEMD 101: LPVIMMSADD SKSVVLKGVT HGAVDYLIKP VRIEALKNIW QHVVRKKRNE WNVSEHSGGS IEDTGGDRDR QQQHREDADN NSSSVNEGNG RSSRKRKEEE 201: VDDQGDDKED SSSLKKPRVV WSVELHQQFV AAVNQLGVDK AVPKKILEMM NVPGLTRENV ASHLQKYRIY LRRLGGVSQH QGNMNHSFMT GQDQSFGPLS 301: SLNGFDLQSL AVTGQLPPQS LAQLQAAGLG RPTLAKPGMS VSPLVDQRSI FNFENPKIRF GDGHGQTMNN GNLLHGVPTG SHMRLRPGQN VQSSGMMLPV 401: ADQLPRGGPS MLPSLGQQPI LSSSVSRRSD LTGALAVRNS IPETNSRVLP TTHSVFNNFP ADLPRSSFPL ASAPGISVPV SVSYQEEVNS SDAKGGSSAA 501: TAGFGNPSYD IFNDFPQHQQ HNKNISNKLN DWDLRNMGLV FSSNQDAATA TATAAFSTSE AYSSSSTQRK RRETDATVVG EHGQNLQSPS RNLYHLNHVF 601: MDGGSVRVKS ERVAETVTCP PANTLFHEQY NQEDLMSAFL KQEGIPSVDN EFEFDGYSID NIQV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)