AT3G29090.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.959 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pectin methylesterase 31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an atypical pectin methylesterase that does not require salt for its activity and has a blockwise mode of pectin demethylesterification. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pectin methylesterase 31 (PME31); FUNCTIONS IN: pectinesterase activity; INVOLVED IN: pectin metabolic process; LOCATED IN: cell wall, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pectinesterase, active site (InterPro:IPR018040), Pectin lyase fold/virulence factor (InterPro:IPR011050), Pectinesterase, catalytic (InterPro:IPR000070), Pectin lyase fold (InterPro:IPR012334); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pectin lyase-like superfamily protein (TAIR:AT5G19730.1); Has 2575 Blast hits to 2532 proteins in 376 species: Archae - 8; Bacteria - 733; Metazoa - 1; Fungi - 195; Plants - 1611; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 27 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:11073804..11075335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35521.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 317 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTRMVRVS QDGSGDYCSV QDAIDSVPLG NTCRTVIRLS PGIYRQPVYV PKRKNFITFA GISPEITVLT WNNTASKIEH HQASRVIGTG TFGCGSVIVE 101: GEDFIAENIT FENSAPEGSG QAVAIRVTAD RCAFYNCRFL GWQDTLYLHH GKQYLKDCYI EGSVDFIFGN STALLEHCHI HCKSQGFITA QSRKSSQEST 201: GYVFLRCVIT GNGQSGYMYL GRPWGPFGRV VLAYTYMDAC IRNVGWHNWG NAENERSACF YEYRCFGPGS CSSERVPWSR ELMDDEAGHF VHHSFVDPEQ 301: DRPWLCLRMG VKTPYSA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)