AT5G62290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nucleotide-sensitive chloride conductance regulator (ICln) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nucleotide-sensitive chloride conductance regulator (ICln) family protein; FUNCTIONS IN: ion channel activity; INVOLVED IN: cell volume homeostasis, chloride transport; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleotide-sensitive chloride conductance regulator (InterPro:IPR003521); Has 295 Blast hits to 295 proteins in 110 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 165; Fungi - 42; Plants - 66; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 22 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25019568..25020972 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25604.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 3.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 229 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVAGLRDFTL RTEDGSGKPV LDESNGEELM HVQTSVAVAL GNRPIESPGT LYITSRKLIW LSDVDMAKGY AVDFLSISLH AVSRDPEAYS SPCIYTQIEV 101: EEDEDDESDS ESTEVLDLSK IREMRLVPSD STQLETLFDV FCECAELNPE PVQEEEEESG HNWVFSADQM DVRGGDDDAE WQISQSPTSV IGHSNGDEGL 201: NQPMLELQIN DQRFEDAEEM VHESETKDH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)