AT2G46230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PIN domain-like family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
PIN domain-like family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF652 (InterPro:IPR006984), Nucleotide binding protein, PINc (InterPro:IPR006596); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: PIN domain-like family protein (TAIR:AT1G26530.1); Has 697 Blast hits to 697 proteins in 237 species: Archae - 32; Bacteria - 0; Metazoa - 241; Fungi - 212; Plants - 105; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 107 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18984459..18985850 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22473.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 196 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKAKKPQKF AVVKKMISHK ALKHYKEEVL NPNKKDLTEL PRNVPSVPAG LFFSYNSTLV PPYRVLVDTN FINFSIQNKI DLEKGMRDCL YANCTPCITD 101: CVMAELEKLG QKYRVALRIA KDPHFERLPC IHKGTYADDC LVDRVTQHKC FIVATCDRDL KRRIRKIPGV PIMYVTNRKY SIEKLPEATL GGAPRY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)