AT2G44860.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 nucleus 0.500 ASURE: cytosol,nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L24e family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L24e family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN: ribosome, cytosolic large ribosomal subunit, nucleolus; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L24e (InterPro:IPR000988), TRASH (InterPro:IPR011017); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L24e family protein (TAIR:AT3G53020.1); Has 1527 Blast hits to 1527 proteins in 399 species: Archae - 307; Bacteria - 5; Metazoa - 446; Fungi - 310; Plants - 198; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 261 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18501034..18502128 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18943.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 159 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRLEKCWFCS STIYPGHGIQ FVRNDAKIFR FCRSKCHKNF KMKRNPRKVK WTKAFRAAHG KDMTKDTTFE FEKKRNRPER YDRNVTENTL MAIKKIAKIR 101: TAREAKHIEN RLKPNKQKKL NDDMKELDQN IHMVQAPGAQ KIKVDVSEKK SVQNEAMEE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)