AT3G18830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : polyol/monosaccharide transporter 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
This gene encodes a plasma membrane-localized polyol/cyclitol/monosaccharide-H+-symporter. The symporter is able to catalyze the energy-dependent membrane passage of a wide range of linear polyols (three to six carbon backbone), of cyclic polyols (<i>myo</i>-inositol), and of numerous monosaccharides, including pyranose ring-forming and furanose ring-forming hexoses and pentoses. This gene belongs to a monosaccharide transporter-like (MST-like) superfamily. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
polyol/monosaccharide transporter 5 (PMT5); FUNCTIONS IN: in 11 functions; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 31 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: polyol/monosaccharide transporter 1 (TAIR:AT2G16120.1); Has 41700 Blast hits to 40955 proteins in 2462 species: Archae - 780; Bacteria - 23122; Metazoa - 5370; Fungi - 7812; Plants - 2713; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1901 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:6489000..6491209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58106.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 539 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTGATPENRT APSPPPVKHV PESVLPAKPP KRNNYAFACA ILASMTSILL GYDIGVMSGA MIYIKRDLKI NDLQIGILAG SLNIYSLIGS CAAGRTSDWI 101: GRRYTIVLAG AIFFAGAILM GLSPNYAFLM FGRFIAGIGV GYALMIAPVY TAEVSPASSR GFLNSFPEVF INAGIMLGYV SNLAFSNLPL KVGWRLMLGI 201: GAVPSVILAI GVLAMPESPR WLVMQGRLGD AKRVLDKTSD SPTEATLRLE DIKHAAGIPA DCHDDVVQVS RRNSHGEGVW RELLIRPTPA VRRVMIAAIG 301: IHFFQQASGI DAVVLFSPRI FKTAGLKTDH QQLLATVAVG VVKTSFILVA TFLLDRIGRR PLLLTSVGGM VLSLAALGTS LTIIDQSEKK VMWAVVVAIA 401: TVMTYVATFS IGAGPITWVY SSEIFPLRLR SQGSSMGVVV NRVTSGVISI SFLPMSKAMT TGGAFYLFGG IATVAWVFFY TFLPETQGRM LEDMDELFSG 501: FRWRDSKSKP KGNPEKTVPN PEVEIGSNKQ WKEGDTQSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)