AT3G03490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peroxin 19-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes one of two PEX19 peroxin isoforms. It is predominantly cytosolic and forms dimers. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peroxin 19-1 (PEX19-1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pex19 protein (InterPro:IPR006708); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: peroxin 19-2 (TAIR:AT5G17550.1); Has 637 Blast hits to 625 proteins in 250 species: Archae - 3; Bacteria - 161; Metazoa - 169; Fungi - 149; Plants - 43; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 112 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:830302..831759 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28290.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.88 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 248 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANSHTDDLD ELLDSALDDF KDLNLSHQRN QREAQEEEEK KRKEETVLLP SGVQGLGMGL PDMRSKKRGK QKVSKEDHVA EALDKLREQT RETVKGLESI 101: SSKQLPASDD DGMVEDFLKQ FEDLAGSKDL ESIVETMMQQ LLSKDILHEP MKELGARYPK WLKENEASLS KEDYKRYSQQ YKLIEELNAV YENEPNNSSK 201: IMEIMQKMQE CGQPPSDIVK EIDPGFDFAS LGQISPEMLE SSPNCCIM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)