AT2G26350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peroxin 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Zinc-binding peroxisomal integral membrane protein (PEX10). Inserted directly from the cytosol into peroxisomes and is involved in importing proteins into the peroxisome. Required for embryogenesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peroxin 10 (PEX10); FUNCTIONS IN: zinc ion binding; INVOLVED IN: in 6 processes; LOCATED IN: cytosol, peroxisome; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 8 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, RING-type, conserved site (InterPro:IPR017907), Zinc finger, RING-type (InterPro:IPR001841), Pex, N-terminal (InterPro:IPR006845), Zinc finger, C3HC4 RING-type (InterPro:IPR018957); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RING membrane-anchor 1 (TAIR:AT4G03510.2); Has 4616 Blast hits to 4603 proteins in 297 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2406; Fungi - 531; Plants - 966; Viruses - 101; Other Eukaryotes - 612 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:11217767..11220415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42616.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.67 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 381 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRLNGDSGPG QDEPGSSGFH GGIRRFPLAA QPEIMRAAEK DDQYASFIHE ACRDAFRHLF GTRIALAYQK EMKLLGQMLY YVLTTGSGQQ TLGEEYCDII 101: QVAGPYGLSP TPARRALFIL YQTAVPYIAE RISTRAATQA VTFDESDEFF GDSHIHSPRM IDLPSSSQVE TSTSVVSRLN DRLMRSWHRA IQRWPVVLPV 201: AREVLQLVLR ANLMLFYFEG FYYHISKRAS GVRYVFIGKQ LNQRPRYQIL GVFLLIQLCI LAAEGLRRSN LSSITSSIQQ ASIGSYQTSG GRGLPVLNEE 301: GNLITSEAEK GNWSTSDSTS TEAVGKCTLC LSTRQHPTAT PCGHVFCWSC IMEWCNEKQE CPLCRTPNTH SSLVCLYHSD F |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)