AT2G45870.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Bestrophin-like protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Bestrophin-like protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Bestrophin-like (InterPro:IPR021134); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Bestrophin-like protein (TAIR:AT3G61320.1); Has 1419 Blast hits to 1415 proteins in 515 species: Archae - 0; Bacteria - 1105; Metazoa - 0; Fungi - 123; Plants - 115; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 76 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:18875928..18877440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46282.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 410 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MYQSMNLSFS SNFTNLSFLK PRLYSGISAR APKSLHFKFN PSCVSSGPKS DDSPLSEKLI SLLKAVPNWS DGIKERRMQQ KRSLYTHENW VRHRSSLRHL 101: RHVSSSPSSR VILSLIPPVF FFTTVAILIA GYNSAVDLDW LPDFFPVLRA SPLPYQLTAP ALALLLVFRT EASYSRFEQG RKAWVKIISG TNDLARLVIS 201: SVHGSGDELI IRDALLRYIV AFPVALKCHV IYGSDIASDL KNVIEVDDLS LILQSKHRPR CVIQFISQSL QLLNLDSTKI DMLETKMMQL QEGIGVCEQL 301: MGIPIPLSYT RLTSRFLVLW HLTLPVILWD DCHWNVVPAT FISAASLFCI EEVGVLIEEP FSMLALDELC AMVLSNSDEA VESKEVIRNR IIAKKRILEI 401: KHSSNGWHKS |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)