AT3G05020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acyl carrier protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an acyl carrier protein expressed in leaves, roots, and dry seeds. Protein is not regulated by light. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
acyl carrier protein 1 (ACP1); FUNCTIONS IN: acyl carrier activity; INVOLVED IN: fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphopantetheine-binding (InterPro:IPR006163), Acyl carrier protein-like (InterPro:IPR009081), Acyl carrier protein (ACP) (InterPro:IPR003231), Phosphopantetheine attachment site (InterPro:IPR006162); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: acyl carrier protein 5 (TAIR:AT5G27200.1); Has 7070 Blast hits to 7070 proteins in 2342 species: Archae - 0; Bacteria - 4637; Metazoa - 167; Fungi - 132; Plants - 369; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1763 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:1391863..1392878 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15056.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 137 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATQFSASVS LQTSCLATTR ISFQKPALIS NHGKTNLSFN LRRSIPSRRL SVSCAAKQET IEKVSAIVKK QLSLTPDKKV VAETKFADLG ADSLDTVEIV 101: MGLEEEFNIQ MAEEKAQKIA TVEQAAELIE ELINEKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)