AT2G36620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ribosomal protein L24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
RPL24A encodes ribosomal protein L24, homolog of cytosolic RPL24, found in archaea and higher eukaryotes. Arabidopsis has two RPL24 homologs, RPL24A (AT2G36620) and RPL24B (AT3G53020). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ribosomal protein L24 (RPL24A); FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN: ribosome, cytosolic large ribosomal subunit, plasma membrane, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L24e (InterPro:IPR000988); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L24e family protein (TAIR:AT3G53020.1); Has 1480 Blast hits to 1465 proteins in 352 species: Archae - 106; Bacteria - 37; Metazoa - 463; Fungi - 306; Plants - 338; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 230 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:15350548..15351819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18851.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 164 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVLKTELCRF SGQKIYPGRG IRFIRSDSQV FLFLNSKCKR YFHNKLKPSK LCWTAMYRKQ HKKDAAQEAV KRRRRATKKP YSRSIVGATL EVIQKKRAEK 101: PEVRDAAREA ALREIKERIK KTKDEKKAKK VEYASKQQKS QVKGNIPKSA APKAAKMGGG GGRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)